Regija se i kulturno i rasno nalazi "na raskrižju" između Indonezije i Melanezije. Najistaknutija kulturna značajka usvojena iz Melanezije je kakehan, tajno muško društvo na Ceramu, jedino takvo društvo u cijelom indonezijskom arhipelagu. Molučki otoci ili "otoci začina" izvorno su bili jedino mjesto gdje su pronađeni muškatni oraščić i klinčići. Već poznati u starom Rimu i vjerojatno mnogo ranije u Kini, ovi željeni začini privlačili su trgovce i imigrante s Jave i drugih indonezijskih otoka, kao i Indijce, Arape i Europljane. Kroz miješane brakove pojavio se široki spektar fizičkih tipova, koji su se često jako razlikovali od sela do sela, a ambonska kultura postala je zadivljujući amalgam ranijih autohtonih kulturnih obilježja s konceptima i vjerovanjima hinduističko-javanskog, arapskog, portugalskog i nizozemskog podrijetla . Područje ambonske kulture može se podijeliti u dvije subkulture, naime Alifuru kulturu unutarnjih plemena Cerama i Pasisir kulturu Ambon-Leasea i obalnih dijelova zapadnog Cerama. Alifuru su hortikulturisti koji su prakticirali lov na glave sve do smirivanja Nizozemaca neposredno prije Prvog svjetskog rata. Većina ambonskih klanova u regiji Pasisir svoje podrijetlo vuče iz planinskih regija Cerama, a Alifuru kultura čini osnovu ambonske kulture. Velik dio Alifuru kulture uništili su revniteljiKršćanski misionari iz regije Pasisir koji nisu mogli shvatiti da je mnogo toga što su napali kao "pogansko" u Ceramu njima bilo sveto u Ambon-Leaseu. To je rezultiralo paradoksom da su kršćanska sela na Ambon-Leaseu, pretvorena prije nekih 400 godina, bolje očuvala svoju kulturnu baštinu nego nedavno pretvorena planinska sela na Ceramu, koja se danas nalaze u kulturnom limbu iu stanju ekonomske depresije . Dok u regiji Pasisir protestantsko kršćanstvo i islam dominiraju svjetonazorom svojih sljedbenika, tradicionalna vjerovanja i običaji ( adat ) nastavljaju upravljati društvenim odnosima u obje vjerske zajednice. Brzo širenje islama u ovoj regiji tijekom petnaestog stoljeća obuzdano je dolaskom Portugalaca (1511.), koji su većinu "poganskog" stanovništva preobratili na rimokatolicizam tijekom stoljeća kolonijalne vladavine. Godine 1605. Nizozemci su ih zamijenili i ostali tamo do 1950. Pretvorili su kršćansko stanovništvo u kalvinističke protestante i uspostavili monopol na začine unatoč žestokom otporu i muslimana i kršćana. U devetnaestom stoljeću, nakon opadanja trgovine začinima, ambonski muslimani su nestali u pozadinu, dok je bogatstvo kršćana postalo sve tješnje povezano s Nizozemcima. Kao povjerljivi i odani vojnici, postali suoslonac nizozemske kolonijalne vojske (KNIL). Pripadajući najbolje obrazovanim skupinama u Nizozemskoj Indiji, mnogi su bili zaposleni u kolonijalnoj upravi i privatnim poduzećima izvan svoje domovine. Ovaj obrazac iseljavanja nastavio se iu razdoblju nakon stjecanja neovisnosti. Muslimani, ranije uglavnom isključeni iz obrazovanja, sada brzo sustižu kršćane i natječu se s njima za poslove. Nakon Drugog svjetskog rata većina ambonskih vojnika ostala je lojalna Nizozemcima i borila se s njima protiv indonezijskih nacionalista. Nizozemski prijenos suvereniteta na Indoneziju doveo je 1950. do proglašenja neovisne Republike Južnih Moluka (RMS), ali to nije uspjelo. U strahu od odmazde nacionalista, oko 4000 ambonskih vojnika i njihovih obitelji "privremeno" je prebačeno u Nizozemsku 1951. Zbog njihove čvrste privrženosti idealu RMS, njihov povratak postao je nemoguć. Nastale frustracije dovele su do niza terorističkih akcija, uključujući spektakularne otmice vlakova 1970-ih. Tijekom cijelog razdoblja progonstva, skupina je pokazivala snažne separatističke tendencije, osujetivši sve pokušaje Nizozemaca da ih asimiliraju. Tek nedavno se pojavila određena volja prema funkcionalnoj integraciji.