Grupos familiares y descendencia. Los Cubeo se consideran una unidad identificada por una economía, una organización social y una ideología específicas. Están formados por clanes patrilineales de poca profundidad genealógica, de mayor a menor, cuyos miembros no pueden establecer vínculos genealógicos directos con sus respectivos fundadores. Cada clan está formado por uno o varios patrilinajes, ordenados sucesivamente de mayor a menor, cuyos miembros reconocenentre sí por su filiación con un antepasado vivo o recientemente fallecido, descendiente a su vez del antepasado del clan. Por último, el linaje se compone de familias nucleares o compuestas. Los clanes Cubeo se dividen en tres fratrías exogámicas cuyos grupos se llaman mutuamente "hermanos" mayores y menores, ya que comparten el mismo lugar de origen y descendencia de la Anaconda ancestral,Las phratries se consideran "el mismo pueblo". Ciertos segmentos de otras phratries e incluso de otros grupos étnicos se reconocen como parientes uterinos ("hijos de la madre"), ya que son hijos de esposas potenciales que estuvieron o están casadas con unidades diferentes de la de Ego, lo que afecta al principio consuetudinario del intercambio tradicional de hermanas. Este grupo, que se denomina a pakoma, incluye a los "hermanos" de una fratría y a los parientes uterinos y constituye la unidad exogámica entre los que está prohibido el matrimonio.

Terminología de parentesco. La terminología del parentesco cubeo sigue los principios del sistema dravidiano. La profundidad genealógica no excede de cinco generaciones -las dos más antiguas y las dos más jóvenes que la de Ego-. El sexo de Alter se marca con los sufijos pertinentes. Existen diferencias referenciales y vocativas en el vocabulario, y se utilizan términos individualizados para cada sexo para determinadas categorías de parientes. Los parientes consanguíneos sondiferenciados terminológicamente según el orden de nacimiento (anterior o posterior), pero no ocurre lo mismo con los afines. Terminológicamente, los parientes consanguíneos de la generación de Ego se diferencian en mayores y menores. Además de diferenciar a los primos cruzados y paralelos, también se distingue entre parientes uterinos, a los que se denomina "hijos de la madre".