Հավանական է, որ Կարաջայի առաջին շփումները «քաղաքակրթության» հետ թվագրվում են տասնվեցերորդ դարի վերջին և տասնյոթերորդ դարի սկզբին, երբ հետախույզները սկսեցին ժամանել Արագուայա-Տոկանտինս հովիտ։ Նրանք գալիս էին Սան Պաուլոյից ցամաքով կամ Պարնաիբա ավազանի գետերով՝ փնտրելով հնդիկ ստրուկներ և ոսկի։ Երբ մոտ 1725 թվականին Գոյասում ոսկի հայտնաբերվեց, մի քանի շրջաններից հանքագործներ գնացին այնտեղ և հիմնեցին գյուղեր տարածաշրջանում: Հենց այս մարդկանց դեմ էր, որ հնդկացիները ստիպված էին պայքարել իրենց տարածքը, ընտանիքները և ազատությունը պաշտպանելու համար: 1774 թվականին ստեղծվել է ռազմական կետ՝ նավարկությունը հեշտացնելու համար։ Կարաջան և Ջավաեն ապրում էին այն պաշտոնում, որը կոչվում էր Նովա Բեյրա գաղութ: Այլ գաղութներ հիմնվեցին ավելի ուշ, բայց ոչ մեկը հաջողակ չէր: Հնդկացիները ստիպված էին հարմարվել կյանքի նոր ձևին և ենթարկվել էին տարբեր վարակիչ հիվանդությունների, որոնց նկատմամբ նրանք չունեին իմունիտետ և որոնց համար բուժում չունեին։

Գոյասում գաղութացման նոր փուլ սկսվեց, երբ ոսկու հանքերը սպառվեցին տասնութերորդ դարի վերջին: Բրազիլիայի անկախությամբ կառավարությունն ավելի շահագրգռված դարձավ Գոյասի տարածքային միասնության պահպանման և տնտեսության վերակառուցման հարցում։ 1863 թվականին Գոյասի նահանգապետ Կոուտո դե Մագալաեսը իջավ Ռիո Արագուայայից։ Նա մտադիր էր զարգացնել շոգենավավարումը և նպաստել գետի սահմանի երկայնքով հողերի գաղութացմանը։ Հիմնադրվեցին նոր գյուղերայս նախաձեռնության արդյունքում Արագուայայի երկայնքով ավելացավ գոլորշու նավարկությունը։ Այնուամենայնիվ, միայն վերջերս է տարածաշրջանը ներգրավվել ազգային տնտեսության մեջ: Հնդկացիների պաշտպանության ծառայությունը (SPI) թույլ է տվել անասնապահներին զբաղեցնել գետին սահմանակից դաշտերը՝ աստիճանաբար ներգրավելով Կարաջա, Ջավա, Տապիրապե և Ավա (Կանոեյրոս) հնդկացիներին և մեծ փոփոխություններ առաջացնելով նրանց կյանքում, ինչպես որ հնդկական տարածքներն էին։ ներխուժել են խոշոր եղջերավոր անասունների հոտերը անձրևների ժամանակ: Երբ 1964 թվականին ռազմական կառավարությունը ստանձնեց իշխանությունը, SPI-ն դադարեց գոյություն ունենալ, և ստեղծվեց Fundação Nacional do Indio (Ազգային հնդկական հիմնադրամ, FUNAI)՝ նմանատիպ գործառույթներով։ Գրողների, ճանապարհորդների, պետական ​​աշխատողների և էթնոլոգների զեկույցները ցույց են տալիս, որ Կարաջայի շրջանում ընդգծված հայաթափվել է տասնյոթերորդից մինչև քսաներորդ դարերը: