Верагодна, што першыя кантакты Караджа з "цывілізацыяй" адносяцца да канца шаснаццатага і пачатку семнаццатага стагоддзяў, калі даследчыкі пачалі прыбываць у даліну Арагуая-Такантынс. Яны прыбылі з Сан-Паўлу па сушы або па рэках басейна Парнаіба, шукаючы індзейскіх рабоў і золата. Калі каля 1725 года ў Гаясе было знойдзена золата, шахцёры з некалькіх рэгіёнаў накіраваліся туды і заснавалі вёскі ў рэгіёне. Менавіта супраць гэтых людзей індзейцы павінны былі змагацца, каб абараніць сваю тэрыторыю, сем'і і свабоду. Для палягчэння навігацыі ў 1774 г. быў створаны ваенны пост. Караджа і Джаваэ жылі на пасадзе, які называўся калонія Нова-Бейра. Іншыя калоніі былі заснаваны пазней, але ні адна не мела поспеху. Індзейцам прыйшлося прыстасоўвацца да новага ладу жыцця і падвяргацца розным заразным хваробам, да якіх у іх не было імунітэту і ад якіх не было лячэння.

Новы этап каланізацыі пачаўся ў Гаясе, калі залатыя капальні былі вычарпаны ў канцы васемнаццатага стагоддзя. З здабыццём Бразіліяй незалежнасці ўрад стаў больш зацікаўлены ў захаванні тэрытарыяльнага адзінства Гаяса і рэструктурызацыі эканомікі. У 1863 г. Кута дэ Магальянс, губернатар Гаяса, спусціўся па рацэ Рыа-Арагуая. Ён меў намер развіваць паравое суднаходства і садзейнічаць каланізацыі зямель уздоўж ракі. Засноўваліся новыя вёскіу выніку гэтай ініцыятывы паравая навігацыя павялічылася ўздоўж Арагуая. Але толькі нядаўна рэгіён быў уцягнуты ў народную гаспадарку. Служба аховы індзейцаў (SPI) дазволіла жывёлагадоўцам заняць палі, якія мяжуюць з ракой, паступова ўцягнуўшы індзейцаў Караджу, Джаваэ, Тапірапе і Ава (Кануэйрас) і выклікаўшы вялікія змены ў іх жыцці, паколькі індзейскія тэрыторыі былі захопліваюцца статкамі буйной рагатай жывёлы ў сезон дажджоў. Калі ваенны ўрад прыйшоў да ўлады ў 1964 годзе, SPI спыніў сваё існаванне і быў створаны Fundação Nacional do Indio (Нацыянальны індыйскі фонд, FUNAI) з аналагічнымі функцыямі. Справаздачы пісьменнікаў, падарожнікаў, дзяржаўных служачых і этнолагаў паказваюць на акцэнтаваную дэпапуляцыю караджы з XVII па ХХ стст.