Jakutska ustna izročila se začenjajo precej pred prvim stikom z Rusi v 17. stoletju, olonkho (Etnografski in arheološki podatki kažejo, da so predniki Jakutov, ki so po nekaterih teorijah identificirani z ljudstvom Kuriakon, živeli na območju blizu Bajkalskega jezera in so bili morda del ujgurske države, ki je mejila na območje, kjer so živeli tudi Ujguri.V štirinajstem stoletju so se predniki Jakutov s čredami konj in goveda v majhnih begunskih skupinah preselili na sever. Po prihodu v dolino Lene so se spopadli in se poročili z domačimi nomadi Evenki in Jukagiri. Tako so se pred rusko hegemonijo vzpostavili tako mirni kot tudi vojni odnosi s severnimi Sibirci, Kitajci, Mongoli in turškimi ljudstvi.

Ko so v dvajsetih letih 16. stoletja k reki Leni prispele prve skupine kozakov, so jih Jakuti sprejeli gostoljubno in bojevito. Sledilo je več spopadov in uporov, ki jih je sprva vodil legendarni jakutski junak Tygyn. Do leta 1642 je dolina Lene carju plačevala davek; mir so dosegli šele po dolgem obleganju mogočne jakutske trdnjave. Leta 1700 je bila v Jakutsku (ustanovljenem leta 1632) zgrajena utrdbaje bilo živahno rusko upravno, trgovsko in versko središče ter izhodišče za nadaljnje raziskovanje Kamčatke in Čukotke. Nekateri Jakuti so se preselili proti severovzhodu na ozemlja, ki jih prej niso obvladovali, in še bolj asimilirali Evenke in Jukagirce. Večina Jakutov pa je ostala na osrednjih travnatih območjih in se včasih asimilirala z Rusi. Jakutski voditelji so sodelovali z ruskimiBoj med jakutskimi skupnostmi se je zmanjšal, čeprav so se še naprej pojavljali kraja konj in občasno protirusko nasilje. Jakutski Robin Hood po imenu Manchari je na primer v 19. stoletju vodil skupino, ki je kradla bogatim (običajno Rusom) in dajala revnim (običajno Jakutom).Pravoslavni duhovniki so se razširili po Jakutiji, vendar so bili njihovi privrženci predvsem v večjih mestih.

Do leta 1900 je izobražena jakutska inteligenca, na katero so vplivali ruski trgovci in politični izgnanci, ustanovila stranko, imenovano Jakutska zveza. Jakutski revolucionarji, kot sta Ojunski in Ammosov, so skupaj z boljševiki, kot je bil Gruzijec Ordžonikidze, vodili revolucijo in državljansko vojno v Jakutiji. utrjevanje revolucije iz leta 1917 se je zavleklo do leta 1920, delno zaradi obsežnihBelci pod vodstvom Kolčaka so nasprotovali rdečim silam. Jakutska republika je bila varna šele leta 1923. Po relativnem miru v času Leninove nove ekonomske politike je sledila ostra kolektivizacija in protinacionalistična kampanja. Intelektualci, kot sta bila Ojunski, ustanovitelj Inštituta za jezike, književnost in zgodovino, in Kulakovski, etnograf, so bili preganjani v 20. in 30. letih 20. stoletja.Zaradi stalinistične politike in druge svetovne vojne so mnogi Jakuti ostali brez svojih tradicionalnih domačij in niso bili navajeni na plačano delo v industriji ali mestih. Izobraževanje je izboljšalo njihove možnosti za prilagoditev in spodbudilo zanimanje za jakutsko preteklost.