Les histoires orales yakoutes commencent bien avant le premier contact avec les Russes au XVIIe siècle. Par exemple, olonkho (Les données ethnographiques et archéologiques suggèrent que les ancêtres des Yakoutes, identifiés dans certaines théories au peuple Kuriakon, vivaient dans une région proche du lac Baïkal et pourraient avoir fait partie de l'État ouïgour limitrophe duAu XIVe siècle, les ancêtres des Yakoutes ont migré vers le nord, perhaos, en petits groupes de réfugiés, avec des troupeaux de chevaux et de bétail. Après leur arrivée dans la vallée de la Lena, ils se sont battus et se sont mariés avec les nomades Evenk et Yukagir. Ainsi, les relations pacifiques et belliqueuses avec les Sibériens du nord, les Chinois, les Mongols et les peuples turcs ont précédé l'hégémonie de la Russie.

Lorsque les premiers groupes de cosaques sont arrivés sur la Lena dans les années 1620, les Yakoutes les ont accueillis avec hospitalité et méfiance. Plusieurs escarmouches et révoltes ont suivi, menées d'abord par le légendaire héros yakoute Tygyn. En 1642, la vallée de la Lena était soumise au tsar ; la paix n'a été gagnée qu'après un long siège d'une formidable forteresse yakoute. En 1700, la colonie fortifiée de Yakoutsk (fondée en 1632) a été détruite.était un centre administratif, commercial et religieux russe très actif et un point de départ pour d'autres explorations au Kamchatka et au Tchoukotka. Certains Yakoutes se sont déplacés vers le nord-est dans des territoires qu'ils n'avaient pas dominés auparavant, s'assimilant davantage aux Evenks et aux Youkagirs. La plupart des Yakoutes, cependant, sont restés dans les prairies centrales, s'assimilant parfois aux Russes. Les dirigeants yakoutes ont coopéré avec les Russes.Les combats entre les communautés yakoutes ont diminué, bien que le vol de chevaux et la violence anti-russe occasionnelle aient continué. Par exemple, un Robin des Bois yakoute nommé Manchari a dirigé une bande qui volait les riches (généralement des Russes) pour donner aux pauvres (généralement des Yakoutes) au dix-neuvième siècle. Les Russes ont été les premiers à se battre contre les Russes.Les prêtres orthodoxes se sont répandus dans toute la Yakoutie, mais leurs fidèles se trouvaient principalement dans les grandes villes.

En 1900, une intelligentsia yakoute lettrée, influencée à la fois par les marchands russes et les exilés politiques, a formé un parti appelé l'Union yakoute. Des révolutionnaires yakoutes tels qu'Oiunskii et Ammosov ont mené la révolution et la guerre civile en Yakoutie, aux côtés de bolcheviks tels que le Géorgien Ordzhonikidze. La consolidation de la révolution de 1917 s'est prolongée jusqu'en 1920, en partie à cause de l'ampleur de la guerre civile en Yakoutie et de l'absence d'un gouvernement de coalition.La République yakoute n'a été établie qu'en 1923. Après un calme relatif pendant la Nouvelle politique économique de Lénine, une dure campagne de collectivisation et d'antinationalisme a suivi. Des intellectuels comme Oiunskii, fondateur de l'Institut des langues, de la littérature et de l'histoire, et Kulakovskii, un ethnographe, ont été persécutés dans les années 1920 et 1930. L'agitation des années 1920 et 1930 s'est poursuivie dans la région.Les politiques staliniennes et la Seconde Guerre mondiale ont privé de nombreux Yakoutes de leurs terres ancestrales et les ont déshabitués du travail salarié dans l'industrie ou en ville. L'éducation a amélioré leurs chances d'adaptation et stimulé leur intérêt pour le passé yakoute.