As historias orais de Yakut comezan moito antes do primeiro contacto cos rusos no século XVII. Por exemplo, olonkho (epopeas) datan polo menos do século X, un período de mestura interétnica, tensións e trastornos que puido ser un período formativo na definición das afiliacións tribais yakut. Os datos etnográficos e arqueolóxicos suxiren que os antepasados ​​dos Yakut, identificados nalgunhas teorías co pobo Kuriakon, vivían nunha zona próxima ao lago Baikal e poderían formar parte do estado uigur que limitaba coa China. No século XIV, os antepasados ​​yakut migraron ao norte, quizais en pequenos grupos de refuxiados, con rabaños de cabalos e gando. Despois da chegada ao val de Lena, loitaron e casáronse cos nómades nativos Evenk e Yukagir. Así, as relacións tanto pacíficas como belixerantes con siberianos do norte, chineses, mongois e pobos turcos precederon á hexemonía rusa.

Cando os primeiros partidos de cosacos chegaron ao río Lena na década de 1620, Yakut recibiunos con hospitalidade e receo. Seguiron varias escaramuzas e revoltas, lideradas nun primeiro momento polo lendario heroe Yakut Tygyn. En 1642 o val de Lena estaba baixo tributo ao zar; a paz só se gañou despois dun longo asedio a unha formidable fortaleza de Yakut. En 1700 o asentamento forte de Yakutsk (fundado en 1632) era un bullicioso centro administrativo, comercial e relixioso ruso e un punto de lanzamento paramáis exploración en Kamchatka e Chukotka. Algúns Yakut trasladáronse cara ao nordeste cara a territorios que antes non dominaran, asimilando aínda máis a Evenk e Yukagir. A maioría dos yakut, con todo, permaneceu nos prados centrais, ás veces asimilando rusos. Os líderes yakut cooperaron cos comandantes e gobernadores rusos, volvéndose activos no comercio, a recollida de impostos sobre as peles, o transporte e o sistema postal. Os combates entre as comunidades yakut diminuíron, aínda que continuaron os ruidos de cabalos e a violencia ocasional contra Rusia. Por exemplo, un Robin Hood de Yakut chamado Manchari dirixiu unha banda que roubaba aos ricos (xeralmente rusos) para regalar aos pobres (normalmente Yakut) no século XIX. Os sacerdotes ortodoxos rusos espalláronse por Yakutia, pero os seus seguidores estaban principalmente nas cidades principais.

En 1900 unha intelectualidade yakut alfabetizada, influenciada tanto por comerciantes rusos como por exiliados políticos, formou un partido chamado Unión Yakut. Revolucionarios yakut como Oiunskii e Ammosov lideraron a Revolución e a guerra civil en Yakutia, xunto con bolxeviques como o xeorxiano Ordzhonikidze. A consolidación da Revolución de 1917 prolongouse ata 1920, en parte debido á ampla oposición ás forzas vermellas dos brancos baixo o mandato de Kolchak. A República Yakut non estivo segura ata 1923. Despois dunha relativa calma durante a Nova Política Económica de Lenin, produciuse unha dura campaña de colectivización e antinacionalista.Intelectuais como Oiunskii, fundador do Instituto de Linguas, Literatura e Historia, e Kulakovskii, etnógrafo, foron perseguidos nos anos 20 e 30. A turbulencia das políticas estalinistas e da Segunda Guerra Mundial deixou a moitos Yakut sen as súas casas tradicionais e pouco afeitos ao traballo industrial ou urbano asalariado. A educación mellorou as súas posibilidades de adaptación e estimulou o interese polo pasado yakut.