Jakutska usmena istorija počinje mnogo pre prvog kontakta sa Rusima u sedamnaestom veku. Na primjer, olonkho (epovi) datiraju barem iz desetog vijeka, perioda međuetničkog miješanja, tenzija i preokreta koji je mogao biti period formiranja u definiranju jakutskih plemenskih pripadnosti. Etnografski i arheološki podaci sugeriraju da su preci Jakuta, koji se u nekim teorijama poistovjećuju s narodom Kuriakon, živjeli u području blizu Bajkalskog jezera i možda su bili dio Ujgurske države koja se graniči s Kinom. Do četrnaestog veka, preci Jakuta su migrirali na sever, možda u malim grupama izbeglica, sa stadima konja i stoke. Po dolasku u dolinu Lene, borili su se i vjenčali se s domaćim nomadima Evenka i Yukagira. Dakle, i mirni i ratoborni odnosi sa severnim Sibircima, Kinezima, Mongolima i Turcima prethodili su ruskoj hegemoniji.

Kada su prve grupe Kozaka stigle na rijeku Lenu 1620-ih, Jakut ih je primio s gostoprimstvom i oprezom. Uslijedilo je nekoliko okršaja i pobuna, koje je najprije predvodio legendarni jakutski heroj Tygyn. Do 1642. dolina Lene je bila pod tributom cara; mir je postignut tek nakon duge opsade strašne jakutske tvrđave. Do 1700. naselje tvrđave Jakutsk (osnovano 1632.) bilo je užurbani ruski administrativni, trgovački i vjerski centar i polazna tačka zadalja istraživanja Kamčatke i Čukotke. Neki Jakuti su se preselili na sjeveroistok na teritorije na kojima ranije nisu dominirali, dodatno asimilirajući Evenke i Yukagire. Većina Jakuta je, međutim, ostala u centralnim livadama, ponekad asimilirajući Ruse. Jakutske vođe su sarađivale sa ruskim komandantima i guvernerima, postajući aktivni u trgovini, prikupljanju poreza na krzno, transportu i poštanskom sistemu. Borbe među zajednicama Jakuta su se smanjile, iako su se šuštanje konja i povremeno antirusko nasilje nastavili. Na primjer, Jakut Robin Hood po imenu Manchari vodio je bend koji je krao od bogatih (obično Rusa) da bi ih dao siromašnima (obično Jakutima) u devetnaestom vijeku. Ruski pravoslavni sveštenici su se širili Jakutijom, ali su njihovi sledbenici bili uglavnom u većim gradovima.

Do 1900. godine pismena jakutska inteligencija, pod utjecajem ruskih trgovaca i političkih prognanika, formirala je stranku pod nazivom Savez Jakuta. Jakutski revolucionari kao što su Ojunski i Ammosov predvodili su revoluciju i građanski rat u Jakutiji, zajedno sa boljševicima kao što je Gruzijac Ordžonikidze. Konsolidacija Revolucije 1917. odugovlačila se do 1920., dijelom zbog opsežnog protivljenja Crvenim snagama od strane Bijelih pod Kolčakom. Republika Jakut nije bila sigurna sve do 1923. Nakon relativnog zatišja tokom Lenjinove nove ekonomske politike, uslijedila je oštra kolektivizacija i antinacionalistička kampanja.Intelektualci poput Ojunskog, osnivača Instituta za jezike, književnost i istoriju, i Kulakovskog, etnografa, bili su proganjani 1920-ih i 1930-ih. Previranja staljinističke politike i Drugi svjetski rat ostavili su mnoge Jakute bez svojih tradicionalnih domaćinstava i nenaviknutih na plaćeni industrijski ili urbani rad. Obrazovanje je poboljšalo njihove šanse za adaptaciju i podstaklo interesovanje za prošlost Jakuta.