Le storie orali degli yakut iniziano ben prima del primo contatto con i russi nel XVII secolo, ad esempio, olonkho (I dati etnografici e archeologici suggeriscono che gli antenati degli Yakut, identificati in alcune teorie con il popolo Kuriakon, vivevano in un'area vicina al lago Baikal e potrebbero aver fatto parte dello stato Uighur, confinante con il lago di Baikal.Nel XIV secolo, gli antenati degli yakut migrarono verso nord, in piccoli gruppi di profughi, con mandrie di cavalli e bovini. Dopo l'arrivo nella Valle della Lena, combatterono e si mescolarono con i nomadi autoctoni Evenk e Yukagir. Così, le relazioni pacifiche e bellicose con i siberiani del nord, i cinesi, i mongoli e i popoli turchi precedettero l'egemonia russa.

Quando i primi gruppi di cosacchi arrivarono sul fiume Lena negli anni '20 del XVI secolo, gli yakut li accolsero con ospitalità e diffidenza. Seguirono numerose scaramucce e rivolte, guidate all'inizio dal leggendario eroe yakut Tygyn. Nel 1642 la Valle della Lena era sottoposta a tributo allo zar; la pace fu conquistata solo dopo un lungo assedio di una formidabile fortezza yakut. Nel 1700 l'insediamento fortificato di Yakutsk (fondato nel 1632)era un vivace centro amministrativo, commerciale e religioso russo e un punto di partenza per ulteriori esplorazioni in Kamchatka e Chukotka. Alcuni yakut si spostarono a nord-est in territori che prima non avevano dominato, assimilando ulteriormente Evenk e Yukagir. La maggior parte degli yakut, tuttavia, rimase nelle praterie centrali, a volte assimilando i russi. I leader yakut cooperarono con i russiLe lotte tra le comunità yakut diminuirono, anche se continuarono i furti di cavalli e le occasionali violenze anti-russe. Ad esempio, nel XIX secolo un Robin Hood yakut di nome Manchari guidò una banda che rubava ai ricchi (di solito russi) per dare ai poveri (di solito yakut).I sacerdoti ortodossi si diffusero in Yakutia, ma i loro seguaci erano soprattutto nelle città principali.

Nel 1900 un'intellighenzia yakutica alfabetizzata, influenzata sia dai mercanti russi che dagli esuli politici, formò un partito chiamato Unione yakutica. Rivoluzionari yakutici come Oiunskii e Ammosov guidarono la Rivoluzione e la guerra civile in Yakutia, insieme a bolscevichi come il georgiano Ordzhonikidze. Il consolidamento della Rivoluzione del 1917 si protrasse fino al 1920, in parte a causa dell'ampiaL'opposizione alle forze rosse da parte dei bianchi sotto Kolchak. La Repubblica dello Yakut non fu sicura fino al 1923. Dopo una relativa calma durante la Nuova Politica Economica di Lenin, seguì una dura campagna di collettivizzazione e antinazionalismo. Intellettuali come Oiunskii, fondatore dell'Istituto di Lingue, Letteratura e Storia, e Kulakovskii, un etnografo, furono perseguitati negli anni '20 e '30. L'agitazione degli anni '60 e '60 fu un'occasione per la pace.Le politiche staliniane e la Seconda Guerra Mondiale hanno lasciato molti yakut senza le loro tradizionali fattorie e non abituati al lavoro industriale o urbano. L'istruzione ha migliorato le loro possibilità di adattamento e ha stimolato l'interesse per il passato yakut.