Jakutu mutvārdu stāsti aizsākās krietni pirms pirmā kontakta ar krieviem 17. gadsimtā, piemēram, olonkho (eposi) datējami vismaz ar 10. gadsimtu, kas ir starpetniskās sajaukšanās, spriedzes un satricinājumu periods, kurš, iespējams, ir bijis noteicošais periods, nosakot jakutu cilšu piederību. Etnogrāfiskie un arheoloģiskie dati liecina, ka jakutu senči, kas dažās teorijās tiek identificēti ar kurjakonu tautu, dzīvoja teritorijā pie Baikāla ezera un, iespējams, bija daļa no uiguru valsts, kas robežojas arLīdz XIV gadsimtam jakutu senči ar zirgu un lopu ganāmpulkiem perhaos nelielās bēgļu grupās migrēja uz ziemeļiem. Pēc ierašanās Lēnas ielejā viņi cīnījās un sadzīvoja ar vietējiem evenku un jukagīru nomadiem. Tādējādi pirms Krievijas hegemonijas izveidojās gan miermīlīgas, gan kareivīgas attiecības ar ziemeļu Sibīrijas iedzīvotājiem, ķīniešiem, mongoļiem un turku tautām.

Kad 1620. gados pie Ļenas upes ieradās pirmie kazaku pulki, jakuti tos uzņēma viesmīlīgi un kareivīgi. Sekoja vairākas sadursmes un sacelšanās, ko sākumā vadīja leģendārais jakutu varonis Tigins. 1642. gadā Ļenas ieleja bija pakļauta nodevai caram; miers tika panākts tikai pēc ilgstoša briesmīgā jakutu cietokšņa aplenkuma. 1700. gadā Jakutskas cietoksnis (dibināts 1632. gadā).daļa jakutu pārcēlās uz ziemeļaustrumiem uz teritorijām, kurās viņi iepriekš nebija valdījuši, turpinot asimilēt evenkus un jukagīrus. Tomēr lielākā daļa jakutu palika centrālajās pļavās, dažkārt asimilējot krievus.Kaujas starp jakutu kopienām samazinājās, lai gan turpinājās zirgu rīdīšana un atsevišķas pretkrievu vardarbības. 19. gadsimtā, piemēram, jakutu Robins Huds vārdā Mančari vadīja bandu, kas aplaupīja bagātos (parasti krievus), lai dotu nabagiem (parasti jakuti). 19. gadsimtā krieviem (parasti jakuti).Pareizticīgo priesteri izplatījās pa visu Jakutiju, bet viņu sekotāji bija galvenokārt lielākajās pilsētās.

Līdz 1900. gadam izglītotā jakutu inteliģence, ko ietekmēja gan krievu tirgotāji, gan politiskie trimdinieki, izveidoja partiju ar nosaukumu Jakutu savienība. 1917. gada revolūciju un pilsoņu karu Jakutijā kopā ar tādiem boļševikiem kā gruzīns Ordžonikidze vadīja tādi revolucionāri kā Ojunskis un Ammosovs. 1917. gada revolūcijas konsolidācija ieilga līdz 1920. gadam, daļēji arī plašās ietekmes dēļ.Kolčaka vadītie baltie spēki pretojās sarkanajiem spēkiem. Jakutu Republika nebija droša līdz 1923. gadam. Pēc relatīvā miera Ļeņina jaunās ekonomiskās politikas laikā sekoja skarba kolektivizācija un pretnacionālistiska kampaņa. 20. un 30. gados tika vajāti tādi intelektuāļi kā Valodu, literatūras un vēstures institūta dibinātājs Ojunskis un etnogrāfs Kulakovskis.Staļinisma politika un Otrais pasaules karš daudzus jakutus atstāja bez viņu tradicionālajām viensētām un nepieradināja pie algota darba rūpniecībā vai pilsētās. Izglītība gan uzlaboja viņu pielāgošanās iespējas, gan veicināja interesi par jakutu pagātni.