Ústne tradície Jakutov sa začínajú oveľa skôr ako prvý kontakt s Rusmi v 17. storočí, olonkho (eposy) sa datujú prinajmenšom do 10. storočia, obdobia medzietnického miešania, napätia a otrasov, ktoré mohlo byť formujúcim obdobím pri určovaní kmeňovej príslušnosti Jakutov. Etnografické a archeologické údaje naznačujú, že predkovia Jakutov, v niektorých teóriách stotožňovaní s národom Kuriakon, žili v oblasti v blízkosti Bajkalského jazera a mohli byť súčasťou ujgurského štátu hraničiacehoČína. v štrnástom storočí sa predkovia Jakutov sťahovali na sever, perhaos v malých skupinách utečencov, so stádami koní a dobytka. po príchode do údolia Leny bojovali a miešali sa s domácimi kočovníkmi Evenkami a Jukagirmi. ruskej hegemónii teda predchádzali mierové aj bojovné vzťahy so severnou Sibírou, Čínou, Mongolmi a turkickými národmi.

Keď v 20. rokoch 16. storočia dorazili k rieke Lene prvé skupiny kozákov, Jakuti ich prijali pohostinne a bojovne. Nasledovalo niekoľko potýčok a povstaní, na čele ktorých stál najprv legendárny jakutský hrdina Tygyn. V roku 1642 sa údolie rieky Leny podriadilo cárovi; mier sa podarilo získať až po dlhom obliehaní hrozivej jakutskej pevnosti. V roku 1700 sa pevnosť Jakutsk (založená v roku 1632)bolo rušným ruským administratívnym, obchodným a náboženským centrom a východiskovým bodom pre ďalšie prieskumy na Kamčatke a Čukotke. Niektorí Jakuti sa presťahovali na severovýchod na územia, ktoré predtým neovládali, a ďalej asimilovali Evenkov a Jukagir. Väčšina Jakutov však zostala v centrálnych lúčnych oblastiach a niekedy asimilovala Rusov.Bojov medzi jakutskými komunitami ubudlo, hoci prepadávanie koní a príležitostné protiruské násilnosti pretrvávali. Napríklad v 19. storočí viedol jakutský Robin Hood menom Manchari skupinu, ktorá okrádala bohatých (zvyčajne Rusov), aby ich rozdala chudobným (zvyčajne Jakutom).Pravoslávni kňazi sa rozšírili po Jakutsku, ale ich stúpenci boli najmä vo veľkých mestách.

Do roku 1900 vytvorila vzdelaná jakutská inteligencia pod vplyvom ruských obchodníkov aj politických emigrantov stranu s názvom Jakutský zväz. Jakutskí revolucionári ako Oiunskij a Ammosov viedli revolúciu a občiansku vojnu v Jakutsku spolu s boľševikmi, ako bol Gruzínec Ordžonikidze. Konsolidácia revolúcie z roku 1917 sa predĺžila až do roku 1920, čiastočne kvôli rozsiahlymPo relatívnom pokoji počas Leninovej novej ekonomickej politiky nasledovala tvrdá kolektivizácia a protinárodná kampaň. Intelektuáli ako Oiunskij, zakladateľ Inštitútu jazykov, literatúry a histórie, a Kulakovskij, etnograf, boli v 20. a 30. rokoch prenasledovaní.Stalinská politika a druhá svetová vojna spôsobili, že mnohí Jakuti zostali bez svojich tradičných usadlostí a neboli zvyknutí na platenú prácu v priemysle alebo v mestách. Vzdelávanie zlepšilo ich šance na adaptáciu a zároveň podnietilo záujem o minulosť Jakutov.