Religijska uvjerenja. Natprirodni svijet Irokeza uključivao je brojna božanstva, od kojih je najvažnije bio Veliki Duh, koji je bio odgovoran za stvaranje ljudi, biljaka i životinja i sila dobra u prirodi. Irokezi su vjerovali da Veliki Duh indirektno vodi živote običnih ljudi. Druga važna božanstva bili su Gromovnik i Tri sestre, duhovi kukuruza, pasulja i tikve. Nasuprot Velikom duhu i drugim silama dobra bili su Zli duh i drugi manji duhovi odgovorni za bolesti i druge nesreće. Prema irokezskom gledištu, obični ljudi nisu mogli direktno komunicirati sa Velikim Duhom, ali su to mogli učiniti indirektno sagorevanjem duhana, koji je prenosio njihove molitve nižim duhovima dobra. Irokezi su snove smatrali važnim natprirodnim znakovima, a ozbiljna pažnja poklanjana je tumačenju snova. Vjerovalo se da snovi izražavaju želju duše, te je kao rezultat toga ispunjenje sna bilo od najveće važnosti za pojedinca.

Oko 1800. Seneka sachem po imenu Zgodno jezero dobio je niz vizija za koje je vjerovao da pokazuju put Irokezima da povrate izgubljeni kulturni integritet i obećavaju natprirodnu pomoć svima onima koji su ga slijedili. Religija Zgodnog jezera naglašavala je mnoge tradicionalne elemente irokejske kulture, ali je uključila i kvekerevjerovanja i aspekte kulture bijelaca. Šezdesetih godina prošlog stoljeća, najmanje polovina Irokežana prihvatila je religiju zgodnog jezera.

Vjerski praktičari. Redovni vjerski specijalisti su bili odsutni; međutim, postojali su honorarni muški i ženski specijalisti poznati kao čuvari vjere čije su prvenstvene odgovornosti bile organiziranje i vođenje glavnih vjerskih obreda. Čuvare vjere postavljali su starješine matrisiba i dodijeljen im je značajan ugled.

Ceremonije. Religijske ceremonije su bile plemenske stvari koje su se prvenstveno ticale poljoprivrede, lečenja bolesti i zahvalnosti. U redoslijedu događanja, šest glavnih ceremonija bili su Javor, Sadnja, Jagoda, Zeleni kukuruz, Žetva i Zimski ili Novogodišnji festivali. Prvih pet u ovom nizu uključivalo je javne ispovijedi nakon kojih su uslijedile grupne ceremonije koje su uključivale govore čuvara vjere, prinose duhana i molitvu. Novogodišnji festival se obično održavao početkom februara i bio je obilježen tumačenjima snova i žrtvovanjem bijelog psa koji je prinošen kako bi se narod očistio od zla.

Art. Jedna od najzanimljivijih irokeških umjetničkih formi je lažna maska ​​za lice. Koriste se u ceremonijama ozdravljenja u Društvu lažnog lica, maske su napravljene od javora, bijelog bora, lipe i topole. Lažne maske za lice se prvo urezuju u živo drvo, a zatim se izrezuju besplatnoi oslikana i dekorisana. Maske predstavljaju duhove koji se otkrivaju tvorcu maski u molitvi i ritualu spaljivanja duhana koji se izvodi prije nego što se maska ​​izrezuje.

Medicina. Bolesti i bolesti pripisuju se natprirodnim uzrocima. Ceremonije izlječenja sastojale su se od grupnih šamanističkih praksi usmjerenih na pomilovanje odgovornih natprirodnih agenata. Jedna od grupa izlječenja bilo je Društvo lažnih lica. Ova društva su se nalazila u svakom selu i, osim ženske čuvarice lažnih lica koja je štitila ritualne potrepštine, sastojala su se samo od muških članova koji su sanjali da učestvuju u ceremonijama lažnog lica.

Smrt i zagrobni život. Kada je sahem umro i njegov nasljednik je imenovan i potvrđen, druga plemena Lige su bila obaviještena i vijeće Lige se sastalo da izvrši ceremoniju saučešća u kojoj je umrli sahem oplakivan i novi sahem je postavljen. Sachemova ceremonija saučešća još se održavala u rezervatima Irokeza 1970-ih. Praktikovane su i ceremonije saučešća za obične ljude. U ranim istorijskim vremenima mrtvi su sahranjivani u sedećem položaju okrenutom prema istoku. Nakon sahrane, uhvaćena ptica je puštena na slobodu u uvjerenju da je odnijela duh pokojnika. U ranijim vremenima mrtvi su ostavljani izloženi na drvenoj skeli, a nakon nekog vremena njihove kosti su odlagane uposebna kuća pokojnika. Irokezi su vjerovali, kao što neki vjeruju i danas, da nakon smrti duša kreće na putovanje i niz iskušenja koja su završila u zemlji mrtvih na nebeskom svijetu. Oplakivanje mrtvih trajalo je godinu dana, nakon čega se vjerovalo da je putovanje duše završeno i priređena gozba koja je označavala dolazak duše u zemlju mrtvih.