Crenzas relixiosas. O mundo sobrenatural dos iroqueses incluía numerosas divindades, a máis importante das cales era o Gran Espírito, que era responsable da creación dos seres humanos, das plantas e dos animais e das forzas do ben na natureza. Os iroqueses crían que o Gran Espírito guiaba indirectamente a vida da xente común. Outras divindades importantes foron Thunderer e as Tres Irmás, os espíritos de Maize, Beans e Squash. Oponse ao Gran Espírito e ás outras forzas do ben estaban o Espírito Maligno e outros espíritos menores responsables da enfermidade e outras desgrazas. Na visión iroquesa, os humanos comúns non podían comunicarse directamente co Gran Espírito, pero podían facelo indirectamente queimando tabaco, que levaba as súas oracións aos espíritos do ben menores. Os iroqueses consideraban os soños como importantes signos sobrenaturais, e prestábase moita atención á interpretación dos soños. Críase que os soños expresaban o desexo da alma e, como resultado, o cumprimento dun soño era de suma importancia para o individuo.

Ao redor de 1800 un sachem de Séneca chamado Lago Guapo recibiu unha serie de visións que, segundo el, mostraban o camiño para que os iroqueses recuperasen a súa perdida integridade cultural e prometeu axuda sobrenatural a todos os que o seguían. A relixión do lago Handsome fixo fincapé en moitos elementos tradicionais da cultura iroquesa, pero tamén incorporou aos cuáqueroscrenzas e aspectos da cultura branca. Na década de 1960, polo menos a metade dos iroqueses aceptaron a relixión do lago Handsome.

Practicantes relixiosos. Ausentes especialistas relixiosos a tempo completo; porén, había especialistas a tempo parcial, homes e mulleres, coñecidos como gardiáns da fe, cuxas responsabilidades principais eran organizar e conducir as principais cerimonias relixiosas. Os gardas da fe eran nomeados polos anciáns da matrisib e tiñan un considerable prestixio.

Cerimonias. As cerimonias relixiosas eran asuntos tribais Preocupados principalmente coa agricultura, a cura de enfermidades e a acción de grazas. Na secuencia de ocorrencia, as seis cerimonias principais foron as festas de Arce, Plantación, Amorodo, Millo Verde, Colleita e Mediados de Inverno ou Ano Novo. Os cinco primeiros desta secuencia implicaron confesións públicas seguidas de cerimonias grupais que incluíron discursos dos gardas da fe, ofrendas de tabaco e oración. O festival de Ano Novo adoitaba celebrarse a principios de febreiro e estaba marcado polas interpretacións dos soños e o sacrificio dun can branco ofrecido para purgar á xente do mal.

Artes. Unha das formas de arte iroquesas máis interesantes é a máscara facial falsa. Usadas nas cerimonias de curación das False Face Societies, as máscaras están feitas de bordo, piñeiro branco, tilo e chopo. As máscaras faciales falsas son talladas primeiro nunha árbore viva e despois córtansee pintadas e decoradas. As máscaras representan espíritos que se revelan ao fabricante de máscaras nun ritual de oración e queima de tabaco que se realiza antes de tallar a máscara.

Medicina. As enfermidades e enfermidades foron atribuídas a causas sobrenaturais. As cerimonias de curación consistían en prácticas chamánicas grupais dirixidas a propiciar aos axentes sobrenaturais responsables. Un dos grupos curadores foi a Sociedade False Face. Estas sociedades atopáronse en cada aldea e, agás unha muller gardián dos rostros falsos que protexía a parafernalia ritual, estaba formada só por membros masculinos que soñaran con participar nas cerimonias de Falso Rostro.

Morte e Alén. Cando un sachem morreu e o seu sucesor foi nomeado e confirmado, as outras tribos da Liga foron informadas e o consello da Liga reuniuse para realizar unha cerimonia de pésame na que se chorou o sachem falecido e se instalou o novo sachem. A cerimonia de pésame do sachem aínda se celebraba nas reservas iroqueses nos anos 70. Tamén se practicaron cerimonias de pésame para a xente do común. Nos primeiros tempos históricos os mortos eran enterrados nunha posición sentada mirando ao leste. Despois do enterro, un paxaro capturado foi liberado na crenza de que levaba o espírito do falecido. Antigamente os mortos quedaban ao descuberto nun andamio de madeira, e despois dun tempo os seus ósos foron depositados nuncasa especial do falecido. Os iroqueses crían, como algúns seguen crendo hoxe, que despois da morte a alma emprendeu unha viaxe e unha serie de experiencias que terminaron na terra dos mortos no mundo do ceo. O loito polos mortos duraba un ano, ao cabo do cal se cría que a viaxe da alma estaba completa e celebrábase unha festa para indicar a chegada da alma á terra dos mortos.