Vjerska uvjerenja. Nadnaravni svijet Irokeza uključivao je brojna božanstva, od kojih je najvažnije bio Veliki Duh, koji je bio odgovoran za stvaranje ljudskih bića, biljaka i životinja te sila dobra u prirodi. Irokezi su vjerovali da Veliki Duh neizravno vodi živote običnih ljudi. Druga važna božanstva bili su Gromovnik i Tri sestre, duhovi kukuruza, graha i tikve. Nasuprot Velikom Duhu i drugim silama dobra bili su Zli Duh i drugi niži duhovi odgovorni za bolesti i druge nesreće. U pogledu Irokeza, obični ljudi nisu mogli izravno komunicirati s Velikim Duhom, ali su to mogli učiniti neizravno spaljivanjem duhana, koji je prenosio njihove molitve nižim duhovima dobra. Irokezi su snove smatrali važnim nadnaravnim znakovima i ozbiljna se pažnja pridavala tumačenju snova. Vjerovalo se da snovi izražavaju želju duše, te je kao rezultat ispunjenje sna bilo od najveće važnosti za pojedinca.

Oko 1800. Seneca sachem po imenu Lijepo jezero primio je niz vizija za koje je vjerovao da pokazuju put Irokezima da povrate svoj izgubljeni kulturni integritet i obećavaju nadnaravnu pomoć svima onima koji ga slijede. Religija Handsome Lake naglašavala je mnoge tradicionalne elemente irokeške kulture, ali je uključivala i kvekerevjerovanja i aspekte bjelačke kulture. U 1960-ima, najmanje polovica Irokežana prihvatila je religiju Zgodnog jezera.

Vjerski praktikanti. Religiozni stručnjaci s punim radnim vremenom bili su odsutni; međutim, postojali su honorarni muškarci i žene stručnjaci poznati kao čuvari vjere čije su primarne odgovornosti bile organiziranje i vođenje glavnih vjerskih obreda. Čuvare vjere imenovali su starješine matrisiba i davao im se znatan ugled.

Svečanosti. Vjerske ceremonije bile su plemenske stvari koje su se primarno bavile zemljoradnjom, liječenjem bolesti i zahvaljivanjem. U slijedu pojavljivanja, šest glavnih ceremonija bili su praznik javora, sadnje, jagoda, zelenog kukuruza, žetve i praznika sredine zime ili Nove godine. Prvih pet u ovom nizu uključivalo je javne ispovijedi nakon kojih su slijedile grupne ceremonije koje su uključivale govore vjernika, ponude duhana i molitvu. Novogodišnja svetkovina obično se održavala početkom veljače, a bila je obilježena tumačenjima snova i žrtvovanjem bijelog psa koji je prinosio da se ljudi očiste od zla.

Umjetnost. Jedna od najzanimljivijih irokeških umjetničkih formi je lažna maska ​​za lice. Koriste se u ceremonijama liječenja u Društvima lažnog lica, a maske su izrađene od javora, bijelog bora, lipe i topole. Lažne maske za lice prvo se urezuju u živo stablo, a zatim se odsjekui oslikana i ukrašena. Maske predstavljaju duhove koji se otkrivaju tvorcu maske u molitvi i obredu spaljivanja duhana koji se izvodi prije rezbarenja maske.

Medicina. Bolest i bolesti pripisivali su se nadnaravnim uzrocima. Ceremonije liječenja sastojale su se od grupnih šamanističkih praksi usmjerenih na umirenje odgovornih nadnaravnih agenata. Jedna od grupa za liječenje bilo je Društvo lažnog lica. Ta su se društva nalazila u svakom selu i, osim ženske čuvarice lažnih lica koja je štitila ritualnu opremu, sastojala su se samo od muških članova koji su sanjali o sudjelovanju u ceremonijama lažnih lica.

Smrt i zagrobni život. Kada je sachem umro, a njegov nasljednik imenovan i potvrđen, druga plemena Lige su bila obaviještena i vijeće Lige se sastalo kako bi obavilo ceremoniju sućuti u kojoj se oplakivalo preminulog sachema i postavljao novi sachem. Sachemova ceremonija sućuti još uvijek se održavala u irokeškim rezervatima 1970-ih. Obredi sućuti prakticirani su i za obične ljude. U rano povijesno doba pokojnici su se pokapali u sjedećem položaju okrenuti prema istoku. Nakon ukopa, uhvaćena ptica je puštena s vjerom da je odnijela duh pokojnika. Ranije su mrtve ostavljali izložene na drvenim skelama, a nakon nekog vremena njihove su kosti polagane uposebna kuća pokojnika. Irokezi su vjerovali, kao što neki nastavljaju vjerovati i danas, da nakon smrti duša kreće na putovanje i niz iskušenja koja završavaju u zemlji mrtvih u nebeskom svijetu. Žalovanje za mrtvima trajalo je godinu dana, nakon čega se vjerovalo da je putovanje duše završeno i održavala se gozba koja je označavala dolazak duše u zemlju mrtvih.