Credoau Crefyddol. Roedd byd goruwchnaturiol yr Iroquois yn cynnwys duwiau niferus, a'r pwysicaf ohonynt oedd yr Ysbryd Mawr, a oedd yn gyfrifol am greu bodau dynol, planhigion ac anifeiliaid, a grymoedd da mewn natur. Roedd yr Iroquois yn credu bod Ysbryd Mawr yn anuniongyrchol yn arwain bywydau pobl gyffredin. duwiau pwysig eraill oedd Thunderer a'r Tair Chwaer, ysbrydion Indrawn, Ffa, a Sboncen. Gwrthwynebu yr Ysbryd Mawr a grymoedd daioni eraill yr oedd Ysbryd Drygionus ac ysbrydion llai eraill yn gyfrifol am afiechyd ac anffawd eraill. Ym marn Iroquois ni allai bodau dynol cyffredin gyfathrebu'n uniongyrchol â'r Ysbryd Mawr, ond gallent wneud hynny'n anuniongyrchol trwy losgi tybaco, a oedd yn cario eu gweddïau i ysbrydion daioni llai. Roedd yr Iroquois yn ystyried breuddwydion yn arwyddion goruwchnaturiol pwysig, a rhoddwyd sylw difrifol i ddehongli breuddwydion. Credid bod breuddwydion yn mynegi dymuniad yr enaid, ac o ganlyniad roedd gwireddu breuddwyd o'r pwys mwyaf i'r unigolyn.

Tua 1800 derbyniodd sachem Seneca o'r enw Handsome Lake gyfres o weledigaethau a oedd, yn ei farn ef, yn dangos y ffordd i'r Iroquois adennill eu cyfanrwydd diwylliannol coll ac addawodd gymorth goruwchnaturiol i bawb a'i dilynodd. Roedd crefydd y Llyn Golygus yn pwysleisio llawer o elfennau traddodiadol o ddiwylliant Iroquoian, ond hefyd yn ymgorffori Crynwrcredoau ac agweddau ar ddiwylliant Gwyn. Yn y 1960au, derbyniodd o leiaf hanner y bobl Iroquoian y Grefydd Llyn golygus.

Ymarferwyr Crefyddol. Roedd arbenigwyr crefyddol llawn amser yn absennol; fodd bynnag, roedd arbenigwyr rhan-amser gwrywaidd a benywaidd o'r enw ceidwaid y ffydd a'u prif gyfrifoldebau oedd trefnu a chynnal y prif seremonïau crefyddol. Penodwyd ceidwaid y ffydd gan henuriaid matrisib a rhoddwyd cryn fri iddynt.

Seremonïau. Materion llwythol oedd seremonïau crefyddol Yn ymwneud yn bennaf â ffermio, gwella afiechyd, a diolchgarwch. Yn nhrefn y digwyddiadau, y chwe phrif seremoni oedd gwyliau Masarnen, Plannu, Mefus, Indrawn Gwyrdd, Cynhaeaf, a Gwyliau Canol Gaeaf neu Flwyddyn Newydd. Roedd y pump cyntaf yn y dilyniant hwn yn ymwneud â chyffesiadau cyhoeddus ac yna Seremonïau grŵp a oedd yn cynnwys areithiau gan geidwaid y ffydd, offrymau tybaco, a gweddi. Roedd gŵyl y Flwyddyn Newydd fel arfer yn cael ei chynnal yn gynnar ym mis Chwefror a chafodd ei nodi gan ddehongliadau breuddwyd ac aberth ci gwyn a gynigir i lanhau pobl drygioni.

Celfyddydau. Un o'r ffurfiau celf Iroquoian mwyaf diddorol yw'r Mwgwd Wyneb Ffug. Wedi'u defnyddio yn seremonïau halltu'r Cymdeithasau Wyneb Ffug, mae'r masgiau wedi'u gwneud o fasarnen, pinwydd gwyn, basswood, a phoplys. Mae masgiau wyneb ffug yn cael eu cerfio'n gyntaf mewn coeden fyw, yna'n cael eu torri'n rhydda phaentio ac addurno. Mae'r masgiau'n cynrychioli gwirodydd sy'n datgelu eu hunain i'r gwneuthurwr masgiau mewn defod gweddi a llosgi tybaco a berfformir Cyn i'r mwgwd gael ei gerfio.

Meddygaeth. Priodolwyd afiechyd ac afiechyd i achosion goruwchnaturiol. Roedd seremonïau halltu yn cynnwys arferion siamanaidd grŵp wedi'u cyfeirio at gymodi'r asiantau Goruwchnaturiol cyfrifol. Un o'r grwpiau halltu oedd y False Face Society. Daethpwyd o hyd i'r cymdeithasau hyn ym mhob pentref ac, heblaw am ferch sy'n cadw'r wynebau ffug a oedd yn amddiffyn y paraphernalia defodol, dim ond aelodau gwrywaidd a oedd wedi breuddwydio am gymryd rhan mewn seremonïau Wyneb Ffug oedd yn eu plith.

Marwolaeth ac ar ôl Bywyd. Pan fu farw sachem ac enwebwyd a chadarnhawyd ei olynydd, hysbyswyd llwythau eraill y Gynghrair a chyfarfu cyngor y Gynghrair i gynnal seremoni cydymdeimlad lle y galarwyd y sachem ymadawedig a gosodwyd y sachem newydd. Roedd seremoni cydymdeimlad y sachem yn dal i gael ei chynnal ar amheuon Iroquois yn y 1970au. Roedd seremonïau cydymdeimlad hefyd yn cael eu hymarfer ar gyfer pobl gyffredin. Yn y cyfnod hanesyddol cynnar claddwyd y meirw mewn man eistedd yn wynebu'r dwyrain. Ar ôl y claddu, rhyddhawyd aderyn a ddaliwyd gan gredu ei fod yn cario ysbryd yr ymadawedig i ffwrdd. Yn gynt gadawyd y meirw yn agored ar sgaffaldiau pren, ac ar ôl amser dyddodwyd eu hesgyrn mewntŷ arbennig yr ymadawedig. Roedd y Iroquois yn credu, fel y mae rhai yn parhau i gredu heddiw, bod ar ôl marwolaeth yr enaid cychwyn ar daith a chyfres o ddioddefaint a ddaeth i ben yn y wlad y meirw yn y byd awyr. Parhaodd galar am y meirw am flwyddyn, ac ar ddiwedd yr amser credid bod taith yr enaid yn gyflawn a chynhaliwyd gwledd i ddynodi dyfodiad yr enaid i wlad y meirw.