Estas necerte ĉu Emberá kaj Wounaan-parolantoj vivis en Mezameriko dum antaŭhispanidaj tempoj. La Darién-regiono de orienta Panamo estis Kuna teritorio inter la malfrua deksesa jarcento kaj dekoka jarcento. Estis tie ke la hispanoj establis El Real en 1600 por protekti la riveran itineron de la Cana orminejoj, iam laŭdire la plej riĉaj en la Amerikoj. Alia fortikaĵo estis konstruita proksime de la buŝo de la Río Sabanas kaj malgrandaj loki-minadkompromisoj formiĝis aliloke. En 1638 la misiisto Fray Adrián de Santo Tomás helpis aglomeri disigitajn kunajn familiojn en vilaĝojn ĉe Pinogana, Capetí, kaj Yaviza. La Kuna rezistis hispanajn postulojn ke ili laboras en minadoperacioj kaj batalis, foje kune kun piratoj, por detrui misiokompromisojn dum la 1700-aj jaroj. La hispanoj rekrutis "Chocó" (per siaj timitaj blovpafiloj) kaj Nigrajn soldulojn en la kontraŭofensivo; la Kuna estis puŝita en Darién-malantaŭojn kaj komencis sian historian migradon trans la kontinenta dislimo al la San Blas-marbordo. Kiel rezulto, la koloniigklopodo malsukcesis, kaj la hispanoj malmuntis siajn fortikaĵojn kaj forlasis la regionon en la malfrua dekoka jarcento.

Emberá komencis loĝigi Darién dum la malfrua dekoka jarcento, kaj ekde la fruaj 1900-aj jaroj okupis la plej multajn el la riverbasenoj. Kelkaj eŭropanoj poste transloĝiĝis tie, formante novajn urbojn, kiuj nun estas dominitaj perHispanlingvaj Nigruloj. La Emberá ekloĝis for de tiuj urboj kaj la du restaj Kunaj areoj. Emberá estis trovita same longe okcidente kiel la kanaldrenado de la 1950-aj jaroj. Wounaan-familioj envojaĝis Panamon dum la 1940-aj jaroj.

Emberá kaj Wounaan-vivo dramece ŝanĝiĝis en Panamo dum la mezo de la dudeka jarcento. Deziro al okcidentaj produktoj alportis ilin en kontantajn ekonomiojn. Ili komercis kun nigraj, hispanlingvaj komercistoj, interŝanĝante kultivaĵojn kaj arbarproduktojn kontraŭ kontantmono. Inter la centoj da fabrikitaj varoj nun gravaj estas maĉetoj, hakilaj kapoj, potoj kaj patoj, fusiloj, kugloj kaj ŝtofo. Vilaĝa organizo fontis de la bezono paroli la hispanan kun tiuj eksteruloj. Emberá-aĝestroj petis la nacian registaron por disponigi instruistojn por siaj riveraj sektoroj, kaj lernejoj estis establitaj ĉe Pulida, Río Tupisa, en 1953 kaj ĉe Naranjal, Río Chico, en 1956. Komence, "vilaĝoj" estis simple kelkaj domanaroj buligitaj ĉirkaŭ pajlo- tegmentitaj lernejdomoj. Daŭrigita misia agado komenciĝis proksimume en la sama tempo. Menonitoj, sponsoritaj fare de la Edukministerio de Panamo, komencis legopovprogramon dizajnitan por registri la Emberá kaj Wounaan-lingvojn produkti tradukojn de religiaj materialoj kun kiuj instrui la indianojn. Hindaj familioj grupiĝis ĉirkaŭ misiaj hejmoj ĉe Lucas en 1954 kaj El Mamey sur la Río Jaqué en 1956. Tri "lernejvilaĝoj" kaj tri "misioj".vilaĝoj" ekzistis en 1960.

Filantropia aventuristo, Harold Baker Fernandez (moknomita "Peruo"), kiu komencis vivi kun la Emberá en 1963, adoptis la manierojn de Emberá kaj Wounaan, lernis ilian kulturon el la perspektivo de internulo, kaj instruis ilin pri sekurigado de terrajtoj.Li konsilis al ili ke, formante vilaĝojn, ili povas peti la registaron pri instruistoj, lernejoj kaj medicinaj provizoj.Per pli efika teritoria kontrolo, li diris al ili, ili povus akiri komarkon, aŭ duonaŭtonoma politika distrikto, kiel havis la Kuna, garantianta indiĝenajn rajtojn pri tero kaj rimedoj. "Vilaĝa modelo", kun lernejdomo, instruista dormejo, kunvenejo kaj vilaĝa vendejo inter pajlaj tegmentaj domoj, disvastigita tra Darién; 1968, ekzistis dek du Emberá-vilaĝoj.La registaro de generalo Omar Torrijos subtenis tiujn iniciatojn, kiuj instigis la indianojn difini sian propran politikan strukturon.Elelektita kuna estro ( kaciko ) enkondukis la kunan politikan modelon ( cacikismo ) kiel la unuaj estroj estis elektitaj. Pliaj dek ok vilaĝoj estis formitaj dum la venontaj du jaroj, kaj en 1970 la Darién Emberá kaj Wounaan formale adoptis novan politikan organizon kiu havis ĉefojn, kongresojn, kaj vilaĝgvidantojn, strukturizitajn laŭ la Kuna sistemo. Antaŭ 1980, kvindek vilaĝoj estis formitaj en Darién kaj aliaj formiĝis direkte alcentra Panamo.

La Emberá kaj Wounaan ricevis komarkostatuson en 1983. La Komarko Emberá - loke nomita "Emberá Drua" - konsistas el du apartaj distriktoj en Darién, Sambú, kaj Cemaco kiuj kovras 4,180 kvadratajn kilometrojn de la Sambú kaj Chucunaque- Tuira basenoj. Kelkaj hispanlingvaj nigruloj restas, sed nur unu malgranda ne-hinda urbo estas ene de la distrikto. Hodiaŭ Emberá Drua havas kvardek vilaĝojn kaj pli ol 8,000 indiĝenajn loĝantojn (83 procentoj Emberá, 16 procentoj Wounaan, kaj 1 procento aliaj).