Ei ole kindel, kas hispaania-eelsel ajal elasid Kesk-Ameerikas emberá ja wounaane keelt kõnelevad inimesed. Panama idaosas asuv Dariéni piirkond oli kuueteistkümnenda sajandi lõpust kaheksateistkümnendani Kunade territoorium. 1600. aastal rajasid hispaanlased sinna El Reali, et kaitsta Cana kullakaevanduste ülesvoolu viivat teed, mis olid kunagi väidetavalt Ameerika rikkamad. Teine kindlus oliRío Sabanas'i suudme lähedale ja mujal tekkisid väikesed kaevandusasulad. 1638. aastal aitas misjonär Fray Adrián de Santo Tomás koondada hajutatud Kuna perekonnad Pinogana, Capetí ja Yaviza küladesse. 1700. aastatel seisid Kuna vastu Hispaania nõudmistele, et nad töötaksid kaevandustöödel, ja võitlesid, mõnikord koos piraatidega, misjoni asulate hävitamiseks.Hispaanlased värbasid "Chocó" (nende kardetud puhurpüssidega) ja mustanahalised palgasõdurid vastupealetungile; kuna suruti Dariéni tagalasse ja algas nende ajalooline ränne üle mandrilõhe San Blasi rannikule. Selle tulemusena kukkusid koloniseerimispüüdlused läbi ning hispaanlased lammutasid oma linnused ja lahkusid piirkonnast 18. sajandi lõpul.

Emberá hakkasid Dariéni asustama 18. sajandi lõpul ja hõivasid 1900. aastate alguseks enamiku jõgikonnast. Mõned eurooplased asusid lõpuks sinna ümber, moodustades uusi linnu, kus nüüd domineerivad hispaaniakeelsed mustanahalised. Emberá asustasid neist linnadest ja kahest allesjäänud kuna piirkonnast eemale. 1950. aastateks leidsid emberá-d kuni kanali drenaažini läänes. Wounaanide perekonnadoli sisenenud Panamasse 1940. aastatel.

Emberá ja Wounaanide elu muutus Panamas dramaatiliselt kahekümnenda sajandi keskel. Soov lääne toodete järele tõi nad rahamajandusse. Nad kauplesid mustanahaliste, hispaania keelt kõnelevate ärimeestega, vahetades põllu- ja metsasaadusi raha vastu. Sadade tööstuskaupade hulgas on nüüd olulised machetid, kirvepead, potid ja pannid, püssid, kuulid ja riie. Külaorganisatsioon.Emberá vanemad palusid riigi valitsusel anda õpetajaid oma jõeäärsetesse sektoritesse ja koolid loodi 1953. aastal Pulidas, Río Tupisa jõel ja 1956. aastal Naranjal, Río Chico jõel. Alguses olid "külad" lihtsalt mõned majapidamised, mis olid koondunud rookatusega koolimajade ümber. Jätkuv misjonitegevus algas umbes samal ajal, kuiaeg. Mennoniidid alustasid Panama haridusministeeriumi toetusel kirjaoskuse programmi, mille eesmärk oli emberá ja wounaani keele salvestamine, et toota religioossete materjalide tõlkeid, mille abil indiaanlasi õpetada. 1954. aastal koondusid indiaanlaste pered misjonäride kodude ümber Lucasesse ja 1956. aastal El Mamey's Río Jaqué jõel. 1960. aastal oli kolm "kooliküla" ja kolm "misjoniküla".

Filantroopiline seikleja Harold Baker Fernandez (hüüdnimega "Peruu"), kes hakkas 1963. aastal elama koos emberadega, võttis omaks emberade ja wounaanide kombed, õppis nende kultuuri siseringi vaatenurgast ja õpetas neile maaõiguste tagamist. Ta andis neile nõu, et külade moodustamise kaudu saaksid nad taotleda valitsuselt õpetajaid, koole ja meditsiinitarbeid. Tõhusamateterritoriaalse kontrolli, ütles ta neile, nad võivad saada comarca, või poolautonoomne poliitiline piirkond, nagu oli ka kunadel, tagades põlisrahvaste õigused maale ja ressurssidele. "Külamudel", kus oli koolimaja, õpetajate ühiselamu, koosolekute saal ja külapood rookatusega majade keskel, levis üle Dariéni; 1968. aastaks oli seal kaksteist emberá küla. Kindral Omar Torrijose valitsus toetas neid algatusi, mis julgustas indiaanlastemääratlevad oma poliitilise struktuuri. Määratud Kunade pealik ( cacique ) võttis kasutusele Kunade poliitilise mudeli ( caciquismo ) kui esimesed pealikud valiti. Järgmise kahe aasta jooksul moodustati veel kaheksateist küla ning 1970. aastal võtsid Darién Emberá ja Wounaan ametlikult vastu uue poliitilise korralduse, milles olid pealikud, kongressid ja külajuhid, mille eeskujuks oli kunade süsteem. 1980. aastaks oli Dariénis moodustatud viiskümmend küla ja teised arenesid Panama keskosa suunas.

Emberá ja Wounaan said 1983. aastal comarca staatuse. Comarca Emberá - mida nimetatakse kohapeal "Emberá Drua" - koosneb kahest eraldi rajoonist Dariénis, Sambú ja Cemaco, mis hõlmavad 4180 ruutkilomeetrit Sambú ja Chucunaque-Tuira vesikonnas. Mõned hispaania keelt kõnelevad mustanahalised on jäänud, kuid rajoonis on ainult üks väike mitteindiaanlaste linn. Täna on Emberá Drua neljakümne külaga ja üle 8000põliselanikud (83 protsenti emberá, 16 protsenti wounaan ja 1 protsent muud).