パナマ東部のダリエン地域は、16世紀後半から18世紀にかけてクナ族の領土であった。 かつてアメリカ大陸で最も豊かであったと言われるカナ金鉱からの上流ルートを守るため、スペイン人が1600年にエル・レアル砦を築いたのはこの地であった。 また、別の砦が建設された。1638年、宣教師アドリアン・デ・サント・トマス（Fray Adrián de Santo Tomás）は、分散していたクナ族の集落をピノガナ（Pinogana）、カペティ（Capetí）、ヤビサ（Yaviza）に集約させた。 クナ族はスペインからの採掘作業への要求に抵抗し、1700年代には海賊とともに宣教師の集落を破壊するために戦った。スペイン人は "チョコ"（吹き矢を武器とする）と黒人の傭兵を反攻に参加させ、クナ族はダリエン奥地に押しやられ、大陸分水嶺を越えてサンブラス海岸への歴史的な移動を開始した。 その結果、植民地化の努力は失敗に終わり、スペイン人は18世紀後半に砦を解体してこの地を去った。

エンベラ族は18世紀後半にダリエンに定住し始め、1900年代初頭には河川流域のほとんどを占拠していた。 やがてヨーロッパ人の一部が定住し、新しい町を形成したが、現在ではスペイン語を話す黒人がその大部分を占めている。 エンベラ族は、これらの町や残存する2つのクナ地域から離れて定住した。 1950年代には、エンベラ族は運河排水路の西側まで広がっていた。 ウーナ族の家族は1940年代にパナマに進出していた。

20世紀半ば、エンベラ族とウーナ族の生活はパナマで劇的に変化した。 西洋製品への憧れから、彼らは現金経済へと移行した。 スペイン語を話す黒人ビジネスマンと交易し、農作物や林産物を現金と交換した。 現在、重要視されている何百もの製造品の中には、鉈、斧の頭、鍋、ライフル銃、弾丸、布などがある。 村の編成エンベラ族の長老たちは、河川流域に教師を派遣するよう国家政府に請願し、1953年にリオ・トゥピサのプリダに、1956年にリオ・チコのナランハルに学校が設立された。 当初は、かや葺き屋根の校舎の周りに数世帯が集まっただけの「村」であった。 持続的な宣教活動が始まったのは、ほぼ同じ頃である。1960年、パナマの教育省の支援を受けたメノナイトたちは、エンベラ語とウーナ語（Wounaan）を記録し、インディオに教えるための宗教資料の翻訳を作成する識字プログラムを開始した。 1954年にはルーカス（Lucas）、1956年にはジャケ川（Río Jaqué）のエル・マメイ（El Mamey）にある宣教師の家の周りにインディオの家族が集まった。 1960年には3つの「学校村」と3つの「伝道村」が存在した。

1963年から琥珀族と生活をともにした博愛主義の冒険家ハロルド・ベイカー・フェルナンデス（愛称 "ペルー"）は、琥珀族とウーナ族の習慣を取り入れ、内部の人間として彼らの文化を学び、土地の権利確保について教えた。 彼は村落を形成することで、教師、学校、医療用品を政府に陳情することができると彼らに助言した。 より効果的な村落の形成を通じて、琥珀族とウーナ族の文化はさらに発展していくだろう。彼は、領土を支配することで、彼らは、その領土を手に入れることができるかもしれないと言った。 コマルカ 村落モデル」はダリエン全土に広がり、1968年までに12のエンベラ村が誕生した。 オマール・トリホス将軍の政府はこうした取り組みを支援し、インディオに次のことを奨励した。任命されたクナ族長( カチーク )はクナの政治モデル( カチキスモ その後2年間でさらに18の村が形成され、1970年にダリエンのエンベラ族とウーナ族は、クナ族に倣った村長、議会、村の指導者を特徴とする新しい政治組織を正式に採用した。 1980年までにダリエンには50の村が形成され、その他の村もパナマ中央部方面に発展した。

エンベラ族とウーナン族は1983年にコマルカの地位を得た。 エンベラ族コマルカ（現地では「エンベラ・ドルア」と呼ばれる）は、ダリエン、サンブー、セマコの2つの独立した地区からなり、サンブーとチュクナケ・トゥイラ盆地の4,180平方キロメートルをカバーしている。 スペイン語を話す黒人も残っているが、インディアン以外の小さな町は地区内に1つしかない。 現在、エンベラ・ドルアには40の村があり、8,000人以上が住んでいる。先住民（エンベラ族83％、ウーナン族16％、その他1％）。