Nav zināms, vai emberu un vunas valodā runājošie iedzīvotāji Centrālamerikā dzīvoja pirmsspāņu laikos. Darienas reģions Panamas austrumos bija kuna teritorija no XVI gadsimta beigām līdz XVIII gadsimtam. 1600. gadā tur spāņi izveidoja El Real, lai aizsargātu augšupceļu no Kana zelta raktuvēm, kas reiz bija bagātākās Amerikā. 1600. gadā tur tika izveidots vēl viens cietoksnis.Sabanas upes ietekas tuvumā, un citviet izveidojās nelielas ieguves vietas. 1638. gadā misionārs Fray Adrián de Santo Tomás palīdzēja apvienot izkliedētās kuna ģimenes ciematos Pinogana, Capetí un Yaviza. 1700. gados kuna pretojās spāņu prasībām strādāt kalnrūpniecībā un cīnījās, dažkārt kopā ar pirātiem, lai iznīcinātu misijas apmetnes.Spāņi pretuzbrukumā iesaistīja "čokū" (ar savām baisajām pūtēju lielgabaliem) un melnādainos algotņus; kuna tika izstumti uz Darienas aizmuguri un sāka savu vēsturisko migrāciju pāri kontinentālajai plaisai uz San Blasa piekrasti. Rezultātā kolonizācijas centieni cieta neveiksmi, un spāņi 18. gadsimta beigās demontēja savus fortus un pameta reģionu.

Emberā sāka apdzīvot Dariēnu 18. gadsimta beigās, un līdz 20. gadsimta 20. gs. 90. gadu sākumam viņi bija aizņēmuši lielāko daļu upju baseinu. Daži eiropieši ar laiku tur pārcēlās, veidojot jaunas pilsētas, kurās tagad dominē spāniski runājošie melnādainie. Emberā apmetās prom no šīm pilsētām un abām atlikušajām kuna teritorijām. 20. gadsimta 50. gados emberā bija sastopami līdz pat kanālu kanalizācijas rietumiem. Wounaan ģimenes40. gados bija iebraukuši Panamā.

20. gadsimta vidū Panamas emberā un vunas dzīve krasi mainījās. Vēlme pēc rietumu produktiem viņus ievirzīja naudas ekonomikā. Viņi tirgojās ar melnādainajiem spāniski runājošajiem uzņēmējiem, mainot labību un meža produktus pret naudu. Starp simtiem ražoto preču, kas tagad ir svarīgas, ir mačetes, cirvju galviņas, katli un pannas, šautenes, lodes un audumi. Ciematu organizācija.Emberá vecākie lūdza valsts valdību nodrošināt skolotājus upju sektoros, un 1953. gadā tika izveidotas skolas Pulida, Rio Tupisa, un 1956. gadā - Naranjal, Rio Chico. Sākotnēji "ciemati" bija tikai dažas mājsaimniecības, kas pulcējās ap skolu ēkām ar kārniņu jumtiem. Aptuveni tajā pašā laikā sākās pastāvīga misionāru darbība.Menonīti ar Panamas Izglītības ministrijas atbalstu uzsāka rakstpratības programmu, kuras mērķis bija ierakstīt emberu un vunas valodu, lai varētu sagatavot reliģisko materiālu tulkojumus, ar kuru palīdzību mācīt indiāņus. 1954. gadā indiāņu ģimenes pulcējās ap misionāru mājām Lucas un 1956. gadā - El Mamey pie Rio Jaqué. 1960. gadā pastāvēja trīs "skolu ciemati" un trīs "misiju ciemati".

Filantrops, piedzīvojumu meklētājs Harolds Beikers Fernandezs (ar iesauku "Peru"), kurš sāka dzīvot kopā ar emberiem 1963. gadā, pārņēma emberu un vunas ieradumus, iepazina viņu kultūru no malas un mācīja viņiem, kā nodrošināt zemes tiesības. Viņš ieteica viņiem, ka, veidojot ciemus, viņi var iesniegt lūgumrakstus valdībai, lai nodrošinātu skolotājus, skolas un medicīniskos piederumus.teritoriālā kontrole, viņš viņiem teica, viņi varētu iegūt comarca, vai pusautonomu politisku apgabalu, līdzīgi kā tas bija kuna, kas garantēja pamatiedzīvotāju tiesības uz zemi un resursiem. "Ciemata modelis" ar skolas ēku, skolotāju kopmītni, sapulču zāli un ciemata veikalu starp salmu jumtiem, izplatījās visā Dariēnā; līdz 1968. gadam bija divpadsmit emberu ciemati. Ģenerāļa Omara Torrijasa valdība atbalstīja šīs iniciatīvas, kas mudināja indiāņus uz to, laipaši nosaka savu politisko struktūru. Iecelts kuna vadonis ( cacique ) ieviesa kuna politisko modeli ( caciquismo ) kā pirmie vadoņi. Nākamo divu gadu laikā tika izveidoti vēl astoņpadsmit ciemi, un 1970. gadā Darienas emberā un vounaan oficiāli pieņēma jaunu politisko organizāciju, kurā bija vadoņi, kongresi un ciemu vadoņi, kas veidota pēc kuna sistēmas parauga. Līdz 1980. gadam Darienā bija izveidoti piecdesmit ciemi, un citi attīstījās Panamas centrālās daļas virzienā.

Emberá un Wounaan saņēma comarca statusu 1983. gadā. Comarca Emberá - vietējais nosaukums ir "Emberá Drua" - sastāv no diviem atsevišķiem rajoniem Darién, Sambú un Cemaco, kas aptver 4180 kvadrātkilometrus Sambú un Chucunaque-Tuira baseinu. Ir palikuši daži spāniski runājoši melnādainie, bet rajonā ir tikai viena neliela pilsēta, kas nav indiāņu pilsēta. Šodien Emberá Drua ir četrdesmit ciemi un vairāk nekā 8000 iedzīvotāju.pamatiedzīvotāji (83 % emberiešu, 16 % vuniešu un 1 % citu iedzīvotāju).