Haijulikani ikiwa wasemaji wa Emberá na Wounaan waliishi Amerika ya Kati wakati wa kabla ya Uhispania. Eneo la Darien la mashariki mwa Panama lilikuwa eneo la Kuna kati ya mwisho wa karne ya kumi na sita na karne ya kumi na nane. Hapo ndipo Wahispania walianzisha El Real mwaka wa 1600 ili kulinda njia ya juu ya mto kutoka kwa migodi ya dhahabu ya Kana, ambayo wakati mmoja iliripotiwa kuwa tajiri zaidi katika Amerika. Ngome nyingine ilijengwa karibu na mdomo wa Río Sabanas na makazi madogo ya uchimbaji madini yaliendelezwa mahali pengine. Mnamo 1638 mmishonari Fray Adrián de Santo Tomás alisaidia kukusanya familia za Kuna zilizotawanywa katika vijiji vya Pinogana, Capetí, na Yaviza. Kuna walipinga madai ya Wahispania kwamba wafanye kazi katika shughuli za uchimbaji madini na walipigana, wakati mwingine pamoja na maharamia, kuharibu makazi ya misheni wakati wa miaka ya 1700. Wahispania waliorodhesha "Chocó" (pamoja na bunduki zao walizoogopa) na mamluki Weusi katika shambulio hilo; Wakuna walisukumwa kwenye nyanda za nyuma za Darién na kuanza uhamiaji wao wa kihistoria kuvuka mgawanyiko wa bara hadi pwani ya San Blas. Kwa hiyo, jitihada za ukoloni zilishindwa, na Wahispania walivunja ngome zao na kuondoka eneo hilo mwishoni mwa karne ya kumi na nane.

Emberá alianza kukaa Darién mwishoni mwa karne ya kumi na nane, na mwanzoni mwa miaka ya 1900 alikuwa amechukua sehemu kubwa ya mabonde ya mito. Baadhi ya Wazungu hatimaye walihamia huko, na kuunda miji mipya, ambayo sasa inaongozwa naWeusi wanaozungumza Kihispania. Waemberá walikaa mbali na miji hii na maeneo mawili ya Kuna mabaki. Emberá zilipatikana hadi magharibi kama mifereji ya maji ifikapo miaka ya 1950. Familia za Wounaan ziliingia Panama wakati wa miaka ya 1940.

Maisha ya Emberá na Wounaan yalibadilika sana nchini Panama katikati ya karne ya ishirini. Tamaa ya bidhaa za Magharibi ilizileta katika uchumi wa pesa. Walifanya biashara na wafanyabiashara Weusi, wanaozungumza Kihispania, wakibadilishana mazao na mazao ya misitu kwa pesa taslimu. Miongoni mwa mamia ya bidhaa za viwandani ambazo sasa ni muhimu ni panga, vichwa vya shoka, vyungu na sufuria, bunduki, risasi, na nguo. Shirika la kijiji lilitokana na hitaji la kuzungumza Kihispania na watu hawa wa nje. Wazee wa Emberá waliiomba serikali ya kitaifa kutoa walimu kwa ajili ya sekta zao za mito, na shule zilianzishwa huko Pulida, Río Tupisa, mwaka wa 1953 na Naranjal, Río Chico, mwaka wa 1956. Hapo awali, "vijiji" vilikuwa ni kaya chache tu zilizounganishwa kuzunguka nyasi- nyumba za shule zilizoezekwa paa. Utendaji endelevu wa umishonari ulianza karibu wakati huohuo. Wamennonite, waliofadhiliwa na Wizara ya Elimu ya Panama, walianza programu ya kusoma na kuandika iliyobuniwa kurekodi lugha za Emberá na Wounaan ili kutokeza tafsiri za nyenzo za kidini za kuwafundisha Wahindi. Familia za Wahindi zilikusanyika karibu na nyumba za wamisionari huko Lucas mnamo 1954 na El Mamey kwenye Río Jaqué mnamo 1956. "Vijiji vitatu vya shule" na "misheni" vitatu.villages" ilikuwepo mwaka wa 1960.

Mhasibu mfadhili, Harold Baker Fernandez (jina la utani "Peru"), ambaye alianza kuishi na Emberá mwaka wa 1963, alichukua njia za Emberá na Wounaan, alijifunza utamaduni wao kutoka kwa mtazamo wa ndani, na Aliwashauri kwamba, kwa kuunda vijiji, wangeweza kuiomba serikali iwapatie walimu, shule na vifaa tiba.Kupitia udhibiti bora wa maeneo, aliwaambia, wanaweza kupata comarca, au wilaya ya kisiasa yenye uhuru kidogo, kama Wakuna walivyokuwa nayo, inayohakikisha haki za wenyeji za ardhi na rasilimali.“Mfano wa kijiji,” wenye nyumba ya shule, bweni la walimu, ukumbi wa mikutano, na duka la kijiji katikati ya nyumba zilizoezekwa kwa nyasi, zilizosambazwa Darién; 1968, kulikuwa na vijiji kumi na viwili vya Emberá.Serikali ya Jenerali Omar Torrijos iliunga mkono mipango hii, ambayo iliwahimiza Wahindi kufafanua muundo wao wa kisiasa.Chifu aliyeteuliwa wa Kuna ( cacique ) alianzisha mtindo wa kisiasa wa Kuna ( > caciquismo ) kama machifu wa kwanza walichaguliwa. Vijiji kumi na nane vya ziada viliundwa katika kipindi cha miaka miwili iliyofuata, na mwaka wa 1970 Darién Emberá na Wounaan walipitisha rasmi shirika jipya la kisiasa ambalo lilikuwa na machifu, mabaraza na viongozi wa vijiji, lililofuata mfumo wa Kuna. Kufikia 1980, vijiji hamsini vilikuwa vimeundwa huko Darién na vingine viliendelezwa kwa mwelekeo waPanama ya kati.

Emberá na Wounaan zilipata hadhi ya comarca mwaka wa 1983. Comarca Emberá—eneo linaloitwa "Emberá Drua" - lina wilaya mbili tofauti huko Darién, Sambú, na Cemaco ambazo zinachukua kilomita za mraba 4,180 za Sambú na Chucunaque- Mabonde ya Tuira. Baadhi ya Weusi wanaozungumza Kihispania wamesalia, lakini ni mji mmoja tu mdogo ambao sio Wahindi ulio ndani ya wilaya hiyo. Leo Emberá Drua ina vijiji arobaini na zaidi ya wakazi 8,000 wa kiasili (asilimia 83 Emberá, 16 asilimia Wounaan, na asilimia 1 nyingine).